民國四十四年依照「台灣省各級漁會改進辦法」，改為「小港區漁會」，隸屬高雄縣政府督導。民國六十八年七月一日，高雄市改制院轄市，小港劃入高雄市轄區，小港區漁會改由高雄市政府主管監督。民國九十三年，因配合政府計畫紅毛港遷村，本會遷移至臨海新村漁港繼續服務漁民至今。

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馬祖區漁會

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