本會在民國六十五年四月奉令，將麥寮、台西、四湖、口湖等四個區漁會合併，於同年六月一日正式成立雲林區漁會。原麥寮、台西、口湖區漁會改為辦事處，在民國八十五年十月十六日增加成立三條崙辦事處。 雲林區漁會設總幹事秉承理事會決議執行任務。在總幹事之下置會務課、推廣課、供銷課、會計課、信用部、保險部、魚市場及口湖、台西、麥寮、三條崙等四個辦事處。各組織單位均以服務漁民為目的。
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台東區漁會轄區包括台東縣的台東市、卑南鄉、太麻里鄉、金峰鄉、大武鄉、達仁鄉等地。東部地區洄游魚類資源豐富，但冬季季節風強盛，漁民作業不易。據民國前十四年日人岸元納次郎之調查，當時台東廳管內，成興灣以南各蕃社之漁業，計有小型漁船筏26隻，以卑南、太麻里、巴聖衛較多，作業方式以投網、地曳網、延繩釣為主，作業季節3~9月，捕撈沙魚、飛魚、魚勿仔魚、鯛等。
淡水區漁會轄區包括新北市淡水、八里、林口、三芝與臺北市北投、士林區等鄉鎮......
瑞芳區漁會位於本省北部,西鄰基隆區漁會,東接貢寮區漁會,北面太平洋,海岸線126公里,轄區漁業:深澳漁港,水湳洞漁港,南雅漁港,鼻頭漁港,轄區漁業:棒受網,延繩釣
民國前五年(西元1907年)，基隆廳三貂灣地區漁會成立三貂灣漁業組合，接受補助辦理網具改善計劃，旋即歸併入基隆漁業組合 。民國二十五年成立三貂灣漁業協同組合，三十年改為漁業會。光復後改組為三貂灣漁業生合作社。民國三十九年改為三貂灣漁會......
民國七十年二月乃將竹南區漁會與後龍區漁會合併，定名為後龍區漁會，會址設於後龍鎮海埔里8鄰131之4號原後龍區漁會所在地，並在竹南設竹南辦事處。 同年四月完成合併改選，經理事會及會員代表大會通過建議更名為「南龍區漁會」，奉苗栗縣政府核准，於民國七十一年七月一日正式更名迄今。
基隆區漁會之設立源於民國前五年(西元1907年)日據時期基隆聽轄內成立基隆、金包里、鼻頭、三貂等四個漁業組合以來，歷經了多次的改組後，於民國六十五年正式更名為基隆區漁會迄今。後又經正負各機關的各項協助規劃，使本會發揮最大服務功能。
本會創於民國30年，即日據時代，成立萬里漁業協同組合，為本鄉第一個漁業團體，於民國32年改組為萬里漁業會。民國34年台灣光復，依照我國「漁業法」及「合作社法」之規定，將原有之「萬里漁業會」劃分為二個工作單位......
