本會前身為花蓮漁業生產組合,成立於民國二十年,於民國三十五年七月正式核准成立花蓮縣漁會,至民國四十四年七月劃分為花蓮、新城兩個區漁會,民國五十年十一月新城區漁會又劃入本會轄區,迄今轄區涵蓋本縣行政區域-北起秀林鄉和平村,南至豐濱鄉靜浦村,會員分佈於秀林、花蓮、吉安、豐濱等沿海鎮市。