本會民國65年4月奉令由原東石、布袋、新塭、義竹4個區漁會合併為嘉義區漁會,並於66年元月將會址遷於現址:布袋鎮興中里後寮路76號(布袋港邊)。且為提昇服務漁友品質,便民措施,陸續於過溝、過路、副瀨、景山等地成立辦事處。
依照漁會法規定,漁會採權責劃分制,分為議事機構及執行機構,議事機構有權,包含會員代表大會、理事會、監事會,執行機構有能,包括總幹事及各課部等,制度化分工、效率化服務。